กระเจี๊ยบแดง


ชื่อวิทยาศาสตร์ Hibiscus sabdariffa L.
ชื่อวงศ์ MALVACEAE
ชื่อสามัญ Jamaica sorrel, Roselle
DNA Barcode
ตัวอย่างที่ 1
รหัสการเก็บ M16-1
รหัสพิพิธภัณฑ์
จังหวัด กาญจนบุรี
ละติจูด - ลองติจูด 14.324613N, 99.348383E, 184
วันที่เก็บ 27.07.2017
ผู้เก็บ วันวิสาข์ ศึกษากิจ

  • ITS2
  • psbA-trnH
  • rbcL
  • matK
sequence ATTGCAGAATCCCGTGAACCATCGAGTTTTTGAACGCAAGTTGCGCCCCAAGCCATTAGG
TCGAGGGCACGTCTGCCTGGGTGTCACGCATCGTTGCCCCCATCCAACCCTTACCCGCAG
GGCATCGGTTGAGGTGTGGGCGGAGAATGGCCTCCCGTGTGCTCACCGCTCGCGGTTGGC
CTAAAATCGAGTCCTCGGCGACCACGGTGCCGCGACAATCGGTGGTGTTGCTTCGAGCTG
CCTCGTTTTTTGTCGTGTGCTGCCGTCGATCCGTGCTCTCTGACCCTTTCGGCACCGCAA
GCACGGTGCTCGCGTCGCGACCCCAGGTCAGGCGGGATTACCCGCTGAGTTTAAGCATAT
CAATAAGCGGAGGAAAAGAAACTTACAAGGATTCCCTTAGTAACGGCGAGCGAACCGGGA
ATAGCCCAGCTTGAGAATCGGTCGCCCTCGGCGTCCGAATTGTAG
คำอธิบาย sequence 5.8S ribosomal RNA(<1…89)/ internal transcribed spacer 2(90…317)/ 28S ribosomal RNA(318…>465)
Genbank -
Link Genbank -
sequence TAATGCTCATAACTTCCCTCTAGACCTAGCTGCTATTGAAGCTCCATCTACAAATGGATA
AGACTTTGGTTTTAGTGTATACGATTTTTTGAAAATAAAGGAGCAATAACCAATTTCTTG
TTCTATCAAGAGTGTTGGTATTGCTCCTTTATTTAGATTTAGTAGTGTTTCTTTTCTTTA
CATTTCTTTACATAAGTTTGTTTTTTCTTTACTTTCACGTTAAGTTTACCTTTTTTATTT
TACCCTATTTATTTCTTATTACCATAAGAAATAAATAAAGGATTTTTAATGAGTTTGATT
TCGTTTTATTGGATTTGACTTAGTATTATACGTTCGTTATGTACTAATATAGTAACGAAT
TTTTATAAATATATAAAATAAATATATAAAAAAAGTAAAAAATACCAAGATTTAAACAAA
ATAAAATAGTATAGTGAAAGTACTATACTATACTATACTATAGTATAGTAGAGGGGCGGA
TGTAGCCAAGTGGATCAAGGCAGTGGAT
คำอธิบาย sequence psbA gene(<1...61)/ intergenic spacer(62...475)/ trnH gene(476...>508)
Genbank -
Link Genbank -
sequence -
คำอธิบาย sequence -
Genbank -
Link Genbank -
sequence TACGAGCCAAAGTTTTAACACAAGAAAACCGAAGTATATATTTTATTTGATACAAACTCT
TTTTTTTTGAAGATCCACTGTGATAATGAGAAAGATTTCTACATATACGCACAAATCGGT
CAACAATATCAGAATCGGAAGAATCGGCCCACGTTGGCTTACTGATGGGATGCCCCAATG
TGTTACAAAATTTCGCCTTAGACAATGATCCGATGAGAGAAATTATTGGAATTCTTGTAT
CCAACGTCTTCATAGCATTATCTATTATAAATGAATTTTCTAGCATTTGACTTCGTACCA
CTAAAGGATTTAATCGCACACTTGAAAGATAGCCCAGAAAGTCGAGAGAATATTTATATA
ATTGATTTATACGGACTCTTCCTGATTGAGTCCACGTGTAAAAATAATATTGCCATAAAT
CTACAAAGTAATATTTCCACTTATTCATCAGAAGAGACGTATCTTTTGAGGACAGAATTG
ACTTTCCTTGATACCTAATAAAATGTATGAAAGGGTCTTTGAACAACCACAGGTTGTTCT
GAAAATCATTATAAAAGACTTCTACAAGATACTCTATTTTTCCATAGAAATAAATTCGTT
CAAGAAAGACTCCAGAAGATGTTGATCGTAAATGAGAAGATTGATTACGGAGAAAAAGGA
AAATGGATTCGTATTCATATGCATGAGAATTATATAGGAACAAGAATAATCTTGGATTCA
AAATCGAAATGGGTTTCTTTGGAGTAATAAACCTCTTCAAATTACAATACTGGTAGAGAG
AGAACCGTAATAAATGCAAAGAAGAAGCATCTTTTACCCAGTAGCGAAGGGCTTG
คำอธิบาย sequence maturase K(<1...>835), patial sequence
Genbank -
Link Genbank -
ตัวอย่างที่ 2
รหัสการเก็บ M16-2
รหัสพิพิธภัณฑ์
จังหวัด พังงา
ละติจูด - ลองติจูด 8.511238N, 98.210279E, 49
วันที่เก็บ 01.09.2017
ผู้เก็บ วันวิสาข์ ศึกษากิจ

ตัวอย่างที่ 3
รหัสการเก็บ M16-3
รหัสพิพิธภัณฑ์
จังหวัด เชียงใหม่
ละติจูด - ลองติจูด 18.531300N, 98.512900E, 810
วันที่เก็บ 22.01.2018
ผู้เก็บ วันวิสาข์ ศึกษากิจ

  • ITS2
  • psbA-trnH
  • rbcL
  • matK
sequence TCCCGTGAACCATCGAGTTTTTGAACGCAAGTTGCGCCCCAAGCCATTAGGCCGAGGGCA
CGTCTGCCTGGGTGTCACGCATCGTTGCCCCCATCCAACCCTTACCCACAGGGCATCGGT
TGAGGTGTGGGCGGAGAATGGCCTCCCGTGCGCTCACCGCTCGCGGTTGGCCTAAAATCG
AGTCCTCGGCGACCACGGTGCCGCGACAATCGGTGGTGTTGCTTCGAGCTGCCTCGTTTT
TTGTCGTGTGCTGCCGTCGATCCGTGCTCTCTGACCCTTTCGGCACCGCAAGCACGGTGC
TCGCATCGCGACCCCAGGTCAGGCGGGATTACCCGCTGAGTTTAAGCATATCAATAAGCG
GAGGAAAAGAAACTTACAAGGATTCCCTTAGTAACGGCGAGCGAACCGGGAATAGCCCAG
CTTGAGAATCGGTCGCCCTCGGCGTCC
คำอธิบาย sequence 5.8S ribosomal RNA(<1…80)/ internal transcribed spacer 2(81…308)/ 28S ribosomal RNA(309…>447)
Genbank -
Link Genbank -
sequence CATAACTTCCCTCTAGACCTAGCTGCTATTGAAGCTCCATCTACAAATGGATAAGACTTT
GGTTTTAGTGTATACGATTTTTTGAAAATAAAGGAGCAATAACCAATTTCTTGTTCTATC
AAGAGTGTTGGTATTGCTCCTTTATTTAGATTTAGTAGTGTTTCTTTTCTTTACATTTCT
TTACATAAGTTTGTTTTTTCTTTACTTTCACGTTAAGTTTACCTTTTTTATTTTACCCTA
TTTATTTCTTATTACCATAAGAAATAAATAAAGGATTTTTAATGAGTTTGATTTCGTTTT
ATTGGATTTGACTTAGTATTATACGTTCGTTATGTACTAATATAGTAACGAATTTTTATA
AATATATAAAATAAATATATAAAAAAAGTAAAAAATACCAAGATTTAAACAAAATAAAAT
AGTATAGTGAAAGTACTATACTATACTATACTATAGTATAGTAGAGGGGCGGATGTAGCC
AAGTGGATCAAGGCAGTGGA
คำอธิบาย sequence psbA gene(<1...54)/ intergenic spacer(55...468)/ trnH gene(469...>500)
Genbank -
Link Genbank -
sequence -
คำอธิบาย sequence -
Genbank -
Link Genbank -
sequence AAGTTTTAACACAAGAAAACCGAAGTATATATTTTATTTGATACAAACTCTTTTTTTTTG
AAGATCCACTGTGATAATGAGAAAGATTTCTACATATACGCACAAATCGGTCAACAATAT
CAGAATCGGAAGAATCGGCCCACGTTGGCTTACTGATGGGATGCCCCAATGTGTTACAAA
ATTTCGCCTTAGACAATGATCCGATGAGAGAAATTATTGGAATTCTTGTATCCAACGTCT
TCATAGCATTATCTATTATAAATGAATTTTCTAGCATTTGACTTCGTACCACTAAAGGAT
TTAATCGCACACTTGAAAGATAGCCCAGAAAGTCGAGAGAATATTTATATAATTGATTTA
TACGGACTCTTCCTGATTGAGTCCACGTGTAAAAATAATATTGCCATAAATCTACAAAGT
AATATTTCCACTTATTCATCAGAAGAGACGTATCTTTTGAGGACAGAATTGACTTTCCTT
GATACCTAATAAAATGTATGAAAGGGTCTTTGAACAACCACAGGTTGTTCTGAAAATCAT
TATAAAAGACTTCTACAAGATACTCTATTTTTCCATAGAAATAAATTCGTTCAAGAAAGA
CTCCAGAAGATGTTGATCGTAAATGAGAAGATTGATTACGGAGAAAAAGGAAAATGGATT
CGTATTCATATGCATGAGAATTATATAGGAACAAGAATAATCTTGGATTCAAAATCGAAA
TGGGTTTCTTTGGAGTAATAAACCTCTTCAAATTACAATACTGGTAGAGAGAGAACCGTA
ATAAATGCAAAGAAGAAGCATCTTTTACCCAGTAGCG
คำอธิบาย sequence maturase K(<1...>817), patial sequence
Genbank -
Link Genbank -